除了内膜的质量，子宫内的环境也可能影响胚胎的着床。例如，子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫腺肌症等子宫结构或功能异常可能会降低着床成功率。

有时母体的免疫系统可能会将胚胎识别为外来物质并排斥，导致着床失败或是早期流产。

试管婴儿过程中需要激素的调控来促进卵泡发育和准备子宫内膜。如果激素水平调节不当，可能会导致内膜与胚胎发育不同步，影响着床。

如果输卵管有积水等问题，可能会影响胚胎移植后的移动和着床。

过度的精神压力、不良的生活方式（如吸烟、饮酒）、过重或过轻的体重等都可能影响试管婴儿的成功率。

目前仍有许多关于生殖医学的未知领域，包括一些尚未完全了解的影响着床成功的生物机制。

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